中國科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)生態(tài)研究所（以下簡稱“亞熱帶生態(tài)所”）創(chuàng)建于1978年，其前身為中國科學(xué)院長沙農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化研究所，2003年10月改為現(xiàn)名。

亞熱帶生態(tài)所主要學(xué)科方向為亞熱帶復(fù)合農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)學(xué)，研究所下設(shè)區(qū)域生態(tài)與農(nóng)業(yè)發(fā)展研究中心、流域農(nóng)業(yè)與生態(tài)環(huán)境研究中心、畜禽健康養(yǎng)殖與農(nóng)牧復(fù)合生態(tài)研究中心、作物分子生態(tài)研究中心，建有桃源農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)觀測研究站（國家級）、環(huán)江喀斯特生態(tài)系統(tǒng)觀測研究站（國家級）、洞庭湖濕地生態(tài)系統(tǒng)觀測研究站（國家級）和長沙農(nóng)業(yè)環(huán)境觀測研究站（院級）。擁有飼草種質(zhì)高效設(shè)計與利用全國重點實驗室（共建）、畜禽養(yǎng)殖污染控制與資源化技術(shù)國家工程實驗室及其他院省級實驗平臺6個。　　

截至2025年1月，有在冊職工206人，其中科研人員151人、支撐人員36人、管理人員19人。人才隊伍中，現(xiàn)有中國工程院院士1人、國家“杰青”1人、國家“優(yōu)青”2人（含海外項目1人）、國家高層次人選1人、國家人才計劃6人、全國優(yōu)秀科技工作者1人、何梁何利獎獲得者1人、國家“創(chuàng)新人才推進(jìn)計劃”重點領(lǐng)域創(chuàng)新團(tuán)隊2個、享受國務(wù)院政府特殊津貼專家11人。中國科學(xué)院人才引進(jìn)計劃入選者11名?、院創(chuàng)新交叉團(tuán)隊2個，“西部之光”入選者26人，院青促會會員20人（優(yōu)秀會員6人）。省科技領(lǐng)軍人才5人、省人才計劃5人?、省杰青16人、省優(yōu)青4人、湖湘青年英才6人、省“三尖”創(chuàng)新人才工程20人、省光召科技獎1人，省政府特殊津貼2人。中國科協(xié)青年人才托舉工程項目入選者2人、國家博士后創(chuàng)新人才支持計劃入選者1人。

現(xiàn)擁有生態(tài)學(xué)專業(yè)學(xué)科博士后流動站在站博士后50余人。擁有生態(tài)學(xué)博士學(xué)位授予點，生態(tài)學(xué)、畜牧學(xué)以及環(huán)境工程學(xué)碩士學(xué)位授予點，目前在讀研究生195人，其中博士研究生94人（含國際生4人），碩士研究生101人。

亞熱帶生態(tài)所是湖南省生態(tài)學(xué)會、湖南省土壤學(xué)會、湖南省動物營養(yǎng)與生態(tài)環(huán)境學(xué)會掛靠單位，主辦有《農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化研究》期刊。